Notatka
Dostęp do tej strony wymaga autoryzacji. Może spróbować zalogować się lub zmienić katalogi.
Dostęp do tej strony wymaga autoryzacji. Możesz spróbować zmienić katalogi.
Uwaga
Ważna aktualizacja z maja 2025 r.: Szanowna społeczność, chcielibyśmy poinformować Cię o nadchodzącej zmianie dotyczącej otwartych zestawów danych Genomics, które są obecnie dostępne za pośrednictwem platformy Azure. Po starannym rozważeniu postanowiliśmy skupić się na nowych inicjatywach, które będą lepiej służyć naszej społeczności i dostosować się do naszych długoterminowych celów. W związku z tym dostęp do otwartych zestawów danych Usługi Genomics na platformie Azure zostanie wycofany w najbliższych miesiącach. Rozumiemy, że te zestawy danych były cenne dla badań, rozwoju i uczenia się, a my głęboko doceniamy wkład i zaangażowanie naszej społeczności w czasie. Dziękujemy za zrozumienie i wsparcie.
Konsorcjum Encyklopedii Elementów DNA (ENCODE) to trwająca międzynarodowa współpraca grup badawczych finansowanych przez National Human Genome Research Institute (NHGRI). Celem ENCODE jest utworzenie kompleksowej listy części elementów funkcjonalnych w ludzkim genomie, w tym elementów, które działają na poziomie białka i RNA, oraz elementów regulacyjnych, które kontrolują komórki i okoliczności, w których gen jest aktywny.
Badacze ENCODE stosują różne testy i metody identyfikowania elementów funkcjonalnych. Odkrywanie i opisywanie elementów genów jest realizowane przede wszystkim przez sekwencjonowanie szerokiego zakresu źródeł RNA, genomikę porównawczą, metody bioinformatyki integracyjnej i nadzór przez człowieka. Elementy regulacyjne są zwykle badane za pomocą badań nadwrażliwości DNA, testów metylacji DNA i immunoprecipitation (IP) białek, które wchodzą w interakcje z DNA i RNA, czyli zmodyfikowanych histonów, czynników transkrypcji, regulatorów chromatyny i białek wiązania RNA, a następnie sekwencjonowania.
Uwaga
Firma Microsoft udostępnia zestawy danych Platformy Azure open na zasadzie "tak, jak to jest". Firma Microsoft nie udziela żadnych gwarancji, wyraźnych lub domniemanych, gwarancji ani warunków w odniesieniu do korzystania z zestawów danych. W zakresie dozwolonym zgodnie z prawem lokalnym firma Microsoft nie ponosi odpowiedzialności za wszelkie szkody lub straty, w tym bezpośrednie, wtórne, specjalne, pośrednie, przypadkowe lub karne wynikające z korzystania z zestawów danych.
Zestaw danych jest udostępniany zgodnie z pierwotnymi warunkami, na jakich firma Microsoft otrzymała dane źródłowe. Zestaw danych może zawierać dane pozyskane z firmy Microsoft.
Źródło danych
Ten zestaw danych jest odzwierciedleniem magazynu danych w witrynie https://www.encodeproject.org/
Woluminy danych i częstotliwość aktualizacji
Ten zestaw danych zawiera około 756 TB danych i jest aktualizowany codziennie.
Lokalizacja usługi Storage
Ten zestaw danych jest przechowywany w regionach świadczenia platformy Azure: Zachodnie stany USA 2 i Zachodnio-środkowe stany USA. Zalecamy lokalizowanie zasobów obliczeniowych w regionie Zachodnie stany USA 2 lub Zachodnio-środkowe stany USA w celu koligacji.
Dostęp do danych
Zachodnie stany USA 2: "https://datasetencode.blob.core.windows.net/dataset"
Zachodnio-środkowe stany USA: "https://datasetencode-secondary.blob.core.windows.net/dataset"
Warunki użytkowania
Użytkownicy danych zewnętrznych mogą swobodnie pobierać, analizować i publikować wyniki na podstawie dowolnych danych ENCODE bez ograniczeń, niezależnie od typu lub rozmiaru, i nie zawiera okresu prolongaty dla producentów danych ENCODE, jako pojedynczych członków lub w ramach konsorcjum. Naukowcy korzystający z nieopublikowanych danych ENCODE są zachęcani do kontaktowania się z producentami danych w celu omówienia możliwych publikacji. Konsorcjum będzie kontynuować publikowanie wyników własnych analiz w niezależnych publikacjach.
Konsorcjum ENCODE wymaga, aby badacze korzystający z zestawów danych ENCODE (opublikowanych lub nie) podawali nazwę konsorcjum ENCODE w prezentacjach i publikacjach na wszystkie ze sposobów opisanych na stronie https://www.encodeproject.org/help/citing-encode/.
Kontakt biznesowy
Jeśli masz jakiekolwiek pytania, wątpliwości lub komentarze, wyślij wiadomość e-mail do działu pomocy technicznej pod adresem encode-help@lists.stanford.edu.
Następne kroki
Wyświetl pozostałe zestawy danych w katalogu Open Datasets (Otwieranie zestawów danych).